Budowę małej synagogi w Kraśniku rozpoczęto w 1823 roku i ukończono w 1857 roku. Była to bożnica dodatkowa, wzniesiona, aby pomieścić wszystkich wiernych na modlitwach. W następnych latach do ściany zachodniej dobudowano przybudówkę z przedsionkiem i domem kahalnym. Podczas II wojny światowej Niemcy zdewastowali synagogę. Po zakończeniu wojny, w 1945 roku budynek adoptowano na magazyn. W 1948 roku urządzono tutaj punkt skupu. W 1966 roku przebudowano częściowo budynek, zamurowując część okien. Od 1986 roku trwają prace renowacyjne, w czerwcu 2006 wykonano szereg robót konserwatorskich, analogicznych do działań w Wielkiej Synagodze. Murowany budynek synagogi został wzniesiony na planie prostokąta o długości ściany bocznej 22 metrów. Budynek jest przykryty czterospadowym dachem, podpartym szkarpami. W głównej sali modlitewnej znajduje się bima z XVIII wieku, wsparta na czterech kolumnach. Na wschodniej ścianie zachował się prosty murowany Aron ha-Kodesz ujęty dwiema półkolumnami.W środku małej synagogi są składowane nagrobki.