Budynek dyrekcji Muzeum był wielokrotnie adaptowany do różnych celów. Pierwotnie (w XVIII wieku) była tu słodownia, potem miejski areszt, w pierwszej połowie XX wieku - areszt gestapo, a potem i polskiej bezpieki, wreszcie w latach 60 zlokalizowano tu Muzeum Jeńców Wojennych. Budynek podniesiono o jedną kondygnację, a na przełomie XX i XXI wieku dobudowano doń prostopadły względem osi ulicy obiekt, w którym mieści się część pomieszczeń pracowników Muzeum oraz segment wystawienniczy (w łączniku ze szklanym dachem).
Dyrekcja Muzeum zarządza także podlegającymi jej i zlokalizowanymi we wsi Łambinowice (ok. 40 km od Opola) na terenach dawnego obozu jenieckiego działami: Oświatowo-Wystawienniczym oraz Zbiorów i Konserwacji -