Do 1993 roku stacja w Łomży obsługiwała połączenia pasażerskie. Po ich zawieszeniu (31 marca 1993 roku), na stację łomżyńską przyjeżdżały tylko pociągi towarowe z Ostrołęki. Z dawnej infrastruktury kolejowej zachowało się niewiele, zwłaszcza że rozebrano budynki dworcowe, na ich miejscu natomiast zlokalizowano miejski bazar. Na początku 2016 roku rozebrano jedyny peron. Obecnie pociągi pasażerskie przyjeżdżają do Łomży tylko w sporadycznych przypadkach.

Ruch prowadzony jest z jednej nastawni "Łm" usytuowanej w km 16,010, która obsługuje również stacyjny przejazd kolejowo-drogowy. Wcześniej istniał również posterunek "Łm-1" oraz "Łm-2" z którego dyżurny ruchu peronowy wyprawiał pociągi pasażerskie.

Aktualizacja: 14.06.2026 roku po ponad 30 latach do Łomży wróciły regularne połączenia pasażerskie.